Il clima di Cernusco Lombardone è simile a quello delle altre località della media e alta Brianza. La maggiore differenziazione è dovuta alla vicinanza dei primi rilievi che dalla pianura portano alle Prealpi Orobiche. A circa 2,5 km verso Ovest vi è il rilievo di Montevecchia (altitudine dai 479 ai 522 metri) mentre 6 km più a Nord – Ovest vi è il rilievo ben più complesso ed esteso del cosiddetto “Monte di Brianza”, le cui vette sono l’Eremo di San Genesio (822 metri) e il Monte Crocione (872 metri). Le Prealpi Orobiche (con la vetta del Resegone, 1875 mt.) sono a meno di 19 km a Nord. Nella zona immediatamente a ridosso del Monte di Brianza si riscontra una piovosità decisamente più marcata rispetto a Cernusco Lombardone, soprattutto nel periodo estivo, con una maggiore incidenza di fenomeni temporaleschi. Tali fenomeni tendono poi normalmente ad estendersi verso Sud e proseguire la loro evoluzione verso Est. Nella maggior parte dei casi tale estensione non riesce a raggiungere Cernusco ma si ferma circa un paio di km più a Nord. E’ così che vi è una decisa differenza di apporti pluviometrici Nord – Sud nel giro di pochissimi chilometri. Dal punto di vista termico, la stazione può avere influssi dalla vicinanza delle abitazioni, essendo posta in un quartiere residenziale (principalmente villette a schiera con giardino). Ci possono così essere leggere differenze termiche in aumento rispetto a dati registrati in aperta campagna, nello stesso paese di Cernusco Lombardone. Dal punto di vista climatologico, si ha un clima con caratteristiche tipicamente continentali. Inverno freddo e asciutto, spesso battuto da venti di caduta dalle Alpi, primavera e autunno piovosi, estate calda e afosa ma abbastanza piovosa a causa di violenti fenomeni temporaleschi, spesso associati a trombe d’aria.